2000年全国高校管理体制改革前，铁道部一共管辖8所本科院校，另有数十所铁路专科学校；改革后仅西南交大、北京交大划归教育部，其余全部移交地方政府，其中2所院校后来并入综合大学，不再独立存在。
一、现存、独立办学的原铁道部本科（6所）
1. 西南交通大学（成都）
原唐山铁道学院，211、双一流，现教育部直属；轨道交通综合实力全国第一，高铁、桥梁、机车、牵引供电顶尖。
2. 北京交通大学（北京，原北方交通大学）
211、双一流，教育部直属；强项轨道交通信号、铁路运营管理、铁路经济，北京区位优势大。
3. 兰州交通大学（原兰州铁道学院）
划转甘肃省；铁路运营、铁道信号、机车供电见长，各大铁路局招聘人数常年领先。
4. 石家庄铁道大学（原石家庄铁道学院）
河北省、国家铁路局、教育部共建；铁道隧道、铁路桥梁土木工程行业认可度顶尖，中铁/铁建工程局首选。
5. 大连交通大学（原大连铁道学院）
划转辽宁省；主打机车车辆、轨道交通装备制造，深度对接中国中车。
6. 华东交通大学（原上海铁道学院，迁江西南昌）
划转江西省；铁路电气、轨道车辆、铁路经管优势突出，华东、华南铁路系统校友多。
二、已合并、撤销，不再独立办学（2所）
长沙铁道学院2000年并入中南大学（985/211），现中南大学铁道校区，土木、轨道交通相关专业保留。
上海铁道大学由上海铁道学院+上海铁道医学院合并组建，2000年整体并入同济大学，铁路、医学专业拆分融入同济。
三、补充：铁道部下属铁路专科院校（现大多为高职）
当年全国各铁路局配套大量铁路专科，现归属地方，举例：武汉铁路职业技术学院、郑州铁路职业技术学院、西安铁路职业技术学院、广州铁路职业技术学院、南京铁道职业技术学院等。
四、重要区分
以下院校从来不属于铁道部，归交通运输部体系，主打公路、水运，不是铁路院校：
重庆交通大学（公路、港口航道）
长安大学（211，公路、桥梁、地质）
山东交通学院、浙江交通职业技术学院等
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